1945年、5月1日……德国。在陷落的柏林，一些人正在进行某个仪式。对他们来说在战争中败北不过是鸡毛蒜皮的小事，甚至还将在战争中产生的大量牺牲者作为仪式的触媒献为祭品。他们的尝试成功了还是失败了，没有人知道。他们在战后隐藏了行踪，不知是生是死，甚至让人无法确定他们是否真实存在过，无人知道真相，只有传言传播。圣枪十三骑士团——纳粹德国的黑暗中诞生的超人们。他们终将回归。其时世界将破灭。故，决不可允许他们的再来——这样一个传言。然后61年的时光流逝。知道他们的存在的人，大部分已经死亡，众人忘记了他们。然而——2006年……日本。就读諏訪原市的学园的藤井蓮，在某事件之后与好友・遊佐司狼决裂，仿佛厮杀般干架的结果是两个月的被迫入院生活。季节由秋转冬——圣诞临近的12月。怀着仿佛半身被夺的丧失感，退院的蓮想着要重新构筑没有司狼的崭新日常生活。往者不可追。那么，至少要珍惜如今手中之物……但是，连这个愿望也分崩离析。每晚梦见的断头台的噩梦。狩猎人头的杀人犯。追杀他的黑衣“骑士”们。超越常识的不条理覆盖城市，逐渐侵蚀。这份异常完全不是两个月前能相比的，暴力到粉碎至今为止积累而成的全部事物的非日常。不改变的话，没法活下去。不活下去的话，没法回去。在以加速度疯狂下去的世界中心，蓮独自跨过日常与非日常的界线。并没有期望什么了不得的事。也不是想高举正义与大义的旗帜。只是，想回去而已。回到没趣、无聊然而平凡、温暖的那段时光。胸怀悲壮的决意，司狼的声音回响。只要还在这个城市，无论是谁迟早都要疯掉——他如是说。与圣枪十三骑士团的战斗。充满狂气与杀戮与诅咒的战争的连续。在那尽头，蓮究竟将会看到什么呢。

在一次偶然中，拥有着对猫过敏的体质的普通少年高坂润平（浅沼晋太郎 配音）无意得罪了供奉在路边的猫地藏，从此，润平将彻底告别“平凡”二字。猫地藏显灵了，作为惩罚，润平必须实现一百只猫咪的愿望，否则，他本人将变成他最讨厌的猫咪。从此之后，各色可爱的猫咪开始出现在了润平的身边。胖胖的老大喵姆萨斯（田中敦子 配音），单纯可爱的小玉（福山润 配音），天然呆的熊猫（神原由衣 配音），高雅傲娇的黑猫奈尔（福井裕佳梨 配音），通过和它们的接触，润平逐渐摆脱了对于猫咪的偏见。在校园中，润平有一个一直暗恋着的女神——水野枫（井口裕香 配音），为了撮合润平和枫，被润平帮助过的猫咪们开始施展起了各自的本事。

故事发生在私立高藤学园的校园中，这一年，童年好友大岛祐树（中村悠一 配音）和住吉千里（中村绘里子 配音）共同升上了二年级。作为在校学生，课后的社团活动是校园生活必不可少的一部分，祐树和千里伙同同学木场冬美（水桥香织 配音）一同组织了“食品研究部”。说是研究部，其实不过就 是大家在一起分享美味的零食，但这简单的活动带给了女孩子们无比美好的课后时光。不幸的是，研究部最大的敌人东云皐月（浅川悠 配音）发出了“解散没有实际成绩的社团”的宣言，而他本人很可能即将当选学生自治会的会长。为了保护心爱的社团，女孩子们决定以竞争对手的身份加入竞选，一场轰轰烈烈的社团保护战开始了。

西条拓己（吉野裕行 配音）是一个标准的废柴，个性懦弱又不负责任的他住在集装箱里，每日除了上课外都宅在家里玩网络游戏，深深沉迷与二次元世界的他认为一切三次元的都与他无关。此时的涉谷地区，正在发生名为“New Gene”的连续猎奇杀人事件，以被害者死状惨烈而臭名昭著。一日，拓己在网络聊天室里遇见了一名自称将军（代永翼 配音）的神秘人物，将军用津津乐道的口吻预言了下一次的猎奇杀人事件始末，并且传来了血腥暴力的现场照片。一开始，拓己只当其是恶作剧者不予理会，但数日后，将军所预言的一切都成为了现实。拓己偷偷潜入犯罪现场，撞见了浑身是血眼神空洞的女生咲畑梨深（喜多村英梨 配音）并认定她就是杀人凶手。但不久之后，梨深却又以昔日老友的身份出现在了拓己面前。凶手究竟是谁？将军的真实面目是什么？在现实与幻想之间，拓己混沌的头脑要做出一次又一次的关乎于性命的选择。

新世历179年，一艘来历不明的巨大物体冲入地球，坠落在南亚得里亚岛。人类在被这一从天而降的怪物吓得惊魂未定之时，以比安.佐尔达克博士为首，科学家们对这一天外来客进行了调查。调查结果表明，此战舰是外宇宙文明所开发出来的战舰，而且令科学家们感到惊恐的是，此战舰中的高科技表明外宇宙科技比地球目前的科技要先进许多。这也证实了比安博士之前就提出过的存在准备向地球进攻的外宇宙文明的假想，地球已经危在旦夕了。在危机一步步逼近的情况下，一部分科学家对于外宇宙的高科技已经恐惧到了极点，许多人提出了逃离地球、移居其它星球的提议，而地球联邦政府的高官们并未意识到此事件的严重性，一方面极力隐瞒巨型战舰坠落的真相，一方面仍然一如继往地过着腐败不堪的生活。在此危急之时，比安博士提出“人类无处可逃”，主张积极地发展军事与科技，全面准备抵抗异星人的入侵。为此以比安博士为首，科学家们加紧对战舰中的EOT技术进行解析与调查；而联邦军中的积极派也开始行动。新世历183年1月，比安博士在南亚得里亚岛的EOT研究机构创建DC组织，并进行对异星人用新机体的研制与开发。新世历185年6月，联邦军极东支部在DC、玛奥军工厂及迪斯拉.雷希研究所的协力下，开始SRX计划。

「竜を飼う国」ロートレアモン騎士国に建つ竜飼い人の育成施設「アンサリヴァン騎竜学院」に通う上級課程一年のアッシュ・ブレイクは、ある特殊な才能を持つにもかかわらず、未だ自分の相棒たる竜が誕生しないことから学院一の問題児とされていた。ある日学院の行事である竜によるレースの最中、他国のスパイに遭遇したアッシュは彼らを退けたものの、崖下へと転落してしまう。その時、アッシュの左腕に刻まれた星刻が輝き、そこから幼竜が誕生したことで生き延びる。しかし生まれた竜は何故か人間の少女の姿をしていて、目覚めた途端に「あたしがあんたの飼い主なのよ！」とアッシュに対して逆飼い主宣言をしてしまう。かくして「あらゆる竜を乗りこなす男」アッシュ・ブレイクは、唯一乗りこなせない相棒エーコと共に波乱の学院生活を送り始めるのだった。