八国联军入京，朝廷出奔，举国局势一度混乱。黄飞鸿（赵文卓饰）与父亲黄麒英（刘询饰）、十四姨（王静莹饰）、徒弟梁宽（莫少聪饰）、鬼脚七（熊欣欣饰）一行人南下番禹，欲与十三姨（关之琳饰）、猪肉荣（郑则仕饰）、牙擦苏（郭晋安饰）汇合。师徒于路同担心海盗夺粮的南粤米仓发生误会，两帮人不打不相识，黄飞鸿助其将盗米贼扭送衙门，惊觉盗米竟是差役领班谢四（张铁林饰）指使。原来南海海盗趁局势混乱，活动频繁，使番禹一地早无官员统制，差役不得已靠偷盗维持口粮。黄飞鸿有感谢四等人忠义，遂放弃赴港计划，与当地海盗单眼英、张玉麟、张保仔等人展开连场搏杀……本片是徐克执导黄飞鸿系列的第五部。

伯爵矢志要将失散八百年的圣经所记载的用来对抗魔鬼的五件“上帝的武装”一一寻回，经过一番努力，他寻得包括亚洲飞鹰Jackie（成龙）在非洲土人手中夺得的“圣灵宝剑”等三件，而另外两件在一伙恐怖分子手中。Jackie的朋友Alan（谭咏麟）的女友Laura（关之琳）在时装表演中遭僧侣打扮的恐怖分子绑架，对方期望用她换得所缺的“上帝的武装”。Alan求助Jackie，Jackie以会从恐怖分子手中抢过来伯爵所缺的那两件“上帝的武装”作担保，从伯爵手中借出他所拥有的三件。Jackie、Alan以及伯爵的女儿西行欧洲，展开救人夺宝的行动。

伯爵矢志要将失散八百年的圣经所记载的用来对抗魔鬼的五件“上帝的武装”一一寻回，经过一番努力，他寻得包括亚洲飞鹰Jackie（成龙）在非洲土人手中夺得的“圣灵宝剑”等三件，而另外两件在一伙恐怖分子手中。Jackie的朋友Alan（谭咏麟）的女友Laura（关之琳）在时装表演中遭僧侣打扮的恐怖分子绑架，对方期望用她换得所缺的“上帝的武装”。Alan求助Jackie，Jackie以会从恐怖分子手中抢过来伯爵所缺的那两件“上帝的武装”作担保，从伯爵手中借出他所拥有的三件。Jackie、Alan以及伯爵的女儿西行欧洲，展开救人夺宝的行动。

伯爵矢志要将失散八百年的圣经所记载的用来对抗魔鬼的五件“上帝的武装”一一寻回，经过一番努力，他寻得包括亚洲飞鹰Jackie（成龙）在非洲土人手中夺得的“圣灵宝剑”等三件，而另外两件在一伙恐怖分子手中。 Jackie的朋友Alan（谭咏麟）的女友Laura（关之琳）在时装表演中遭僧侣打扮的恐怖分子绑架，对方期望用她换得所缺的“上帝的武装”。 Alan求助Jackie，Jackie以会从恐怖分子手中抢过来伯爵所缺的那两件“上帝的武装”作担保，从伯爵手中借出他所拥有的三件。Jackie、Alan以及伯爵的女儿西行欧洲，展开救人夺宝的行动。